污水處理菌種很多種，涉及的污水處理眾多，出的污水也不是單一的河道污水等適用于生態環境破壞的水質，養殖場污水處理，河道修復處理，養殖尾水處理，河道水質優化，工廠廢水處理等。

水質優化處理：通過濾水菌分段投入使用，改善了水質，有效降低了部分生活污水造成的水體富營養化的問題，分解多余的有機質和油脂等，令水質更澄明。

廢水處理:廢水處理中的的污水中有機物濃度和懸浮固體濃度高，工廠自帶的預處理系統前期通過調節水量、水質；去除SS、懸浮物；削減部分污染負荷，為后續的微生物處理創造良好條件。乾界生物技術部針對此廢水中COD嚴重超標的情況，將現場廢水處理設備改造，針對性的配置了微生物產品結合沉淀池的活性污泥，將廢水的COD降低到排放標準。

養殖場污水處理：養殖廢水主要包括動物尿液、部分糞便和養殖欄沖洗水，水中富含氮、磷、有機物、高懸浮物，是一種高濃度有機廢水。養殖場廢水會污染地表水和地下水源，污染大氣環境，并會引起傳染病和寄生蟲病的蔓延，傳播人畜共患病，直接危害人體健康，所以對它的處理至關重要。

1、糞便和沖洗用水混合進入到干濕分離設備，固體部分另行處理，經過擠壓減量后的污水進入到原水池中，氣浮機將稍微大的浮游物質和固定分離出來，污水進入一級曝氣池。原水池中的底泥雜質等定期清理抽出，固體分離物收集池中撒入除臭菌進行除臭處理，定期清理。

2、廢水進入曝氣池，加入微生物菌劑，在充足曝氣的條件下，復合微生物大量繁殖，對污水中的有機物起到分解、絮凝作用。上層水進入到下一級曝氣池，再次加入微生物菌劑進行分解，經過三次曝氣處理后進入到沉淀池1，將絮凝分解后的懸浮物沉降于池底。每個曝氣池的容量為70-100噸，可保證每天的處理水量。

3、一級沉淀池的污水經過處理已經較大改善，臭味消除，懸浮物大量降低，有機成份大幅度下降。沉淀池中的上清液流入到二級曝氣系統，同樣經過三次曝氣和微生物菌的處理，再進入到二級沉淀。

4、二級沉淀的上層水到一個收集池，污水處理完成。處理后的水將達到農田灌溉標準可作為農業用水使用，或養殖場沖洗用的用水循環利用。