空格可用下劃線代替,例如“H2O_O2,gjf”,“Graphene_NH3,gjf”,接下來(lái),我們以上圖為例介紹Gaussian輸入文件(,gjf)中所包含的信息,主要涉及到5部分內(nèi)容:,計(jì)算資源分配及輸出結(jié)果保存部分,倘若我們要對(duì)一個(gè)Fe3+進(jìn)行模擬,但并不知道自旋多重度應(yīng)取何值,且不擅長(zhǎng)或無(wú)法通過軌道理論進(jìn)行判斷,那么可以通過計(jì)算Fe3+在不同自旋多重度下的單點(diǎn)能的方式來(lái)尋找其基態(tài)自旋多重度。
原子間的連接方式,這些字樣代表原子之間的連接關(guān)系,對(duì)于量化模擬毫無(wú)意義,故而可直接刪掉,這是由于量化模擬會(huì)在計(jì)算過程中根據(jù)原子各自電子云間的交疊情況自主判斷成鍵形式,因此軟件并不關(guān)心輸入模型中的化學(xué)鍵,換言之,在建模時(shí),水分子中O和H之間畫成單鍵抑或三鍵,對(duì)于計(jì)算結(jié)果沒有任何影響,那么此時(shí),Results欄中的“Vibrations”可選,從中可以分析分子的所有振動(dòng)形式及對(duì)應(yīng)的紅外光譜出峰位置,進(jìn)而生成該分子的理論紅外光譜。
輸入文件:文件后綴名通常為,gjf,包含模擬任務(wù)的計(jì)算資源分配(核數(shù)、內(nèi)存使用情況)、計(jì)算方法和精度、任務(wù)要求及計(jì)算模型等信息,輸出文件:文件后綴名通常為,out或,log,除輸出作為計(jì)算結(jié)果的結(jié)構(gòu)模型、軌道、密度矩陣、電荷布局等信息外,還包括了部分計(jì)算過程中輸出信息,對(duì)于大多數(shù)含有過渡金屬的結(jié)構(gòu)、自由基結(jié)構(gòu)、激發(fā)態(tài),如二茂鐵、基態(tài)氧分子、羥基自由基等,均為開殼層體系,自旋多重度大于1,需做進(jìn)一步判斷。