Linux下的轉換方法:formchkH2O,chk,即可生成H2O,fchk文件,Windows下可直接使用Gaussian軟件自帶的Utilities-FormChk模塊進行轉化,生成對應的,fch文件,輸出文件,out的查看,打開H2O,out文件后托至文檔末尾,可以看到一句名人名言以及計算耗時等信息,表明計算任務順利結束,若任務失敗,則會提示任務失敗并中斷,此時需根據報錯信息來排查可能的問題并修改輸入文件。
本文將以一些簡單的例子來介紹基于Gaussian軟件進行模擬的操作流程,并對其中涉及到的輸入、輸出文件內容的關鍵信息進行介紹,軟件安裝,利用Gaussian軟件進行量化模擬,一般會需要安裝3個軟件,即:Gaussian09,GaussView和Multiwfn三個軟件,若是打算利用服務器或超算中心(Linux系統)進行計算,建議在自己的本地電腦上安裝GaussView和Multiwfn,在服務器上安裝Gaussian主程序即可。
輸入文件:文件后綴名通常為,gjf,包含模擬任務的計算資源分配(核數、內存使用情況)、計算方法和精度、任務要求及計算模型等信息,輸出文件:文件后綴名通常為,out或,log,除輸出作為計算結果的結構模型、軌道、密度矩陣、電荷布局等信息外,還包括了部分計算過程中輸出信息,對于大多數含有過渡金屬的結構、自由基結構、激發態,如二茂鐵、基態氧分子、羥基自由基等,均為開殼層體系,自旋多重度大于1,需做進一步判斷。