空格可用下劃線代替,例如“H2O_O2,gjf”,“Graphene_NH3,gjf”,接下來,我們以上圖為例介紹Gaussian輸入文件(,gjf)中所包含的信息,主要涉及到5部分內容:,計算資源分配及輸出結果保存部分,倘若我們要對一個Fe3+進行模擬,但并不知道自旋多重度應取何值,且不擅長或無法通過軌道理論進行判斷,那么可以通過計算Fe3+在不同自旋多重度下的單點能的方式來尋找其基態自旋多重度。
本文將以一些簡單的例子來介紹基于Gaussian軟件進行模擬的操作流程,并對其中涉及到的輸入、輸出文件內容的關鍵信息進行介紹,軟件安裝,利用Gaussian軟件進行量化模擬,一般會需要安裝3個軟件,即:Gaussian09,GaussView和Multiwfn三個軟件,若是打算利用服務器或超算中心(Linux系統)進行計算,建議在自己的本地電腦上安裝GaussView和Multiwfn,在服務器上安裝Gaussian主程序即可。
輸入文件:文件后綴名通常為,gjf,包含模擬任務的計算資源分配(核數、內存使用情況)、計算方法和精度、任務要求及計算模型等信息,輸出文件:文件后綴名通常為,out或,log,除輸出作為計算結果的結構模型、軌道、密度矩陣、電荷布局等信息外,還包括了部分計算過程中輸出信息,對于大多數含有過渡金屬的結構、自由基結構、激發態,如二茂鐵、基態氧分子、羥基自由基等,均為開殼層體系,自旋多重度大于1,需做進一步判斷。