*補充說明:輸入文件,gjf內容的zui末尾務必保證存在空行,否則在計算過程中會報錯,在Linux服務器中進行模擬,通過SSH遠程連接服務器(圖中使用Xshell和Xftp軟件),Xftp用于在本地電腦和服務器間傳輸文件,在服務器端選擇合適的路徑建立文件夾并重命名為“H2O_opt”后進入該文件夾,將本地電腦端的H2O,隨后“ctrl+c”切出,并用“exit”命令即可關閉SSH遠程連接而不導致計算任務中斷。
Gaussian量化模擬:基本理論與操作實踐,Gaussian軟件適用范圍,基于Gaussian軟件進行的量化模擬主要應用對象為孤立體系,即針對非周期性結構的結構及性質進行計算和分析,若想生成拉曼光譜,則應選擇“11PlotIR/Raman/UV-Vis/ECD/VCD/ROA/NMRspectrum”—“2:Raman(orpre-resonanceRaman)”—“19ConvertRamanactivitiestointensities”,依次輸入激光波長(如532nm)和溫度(如298。
輸入文件:文件后綴名通常為,gjf,包含模擬任務的計算資源分配(核數、內存使用情況)、計算方法和精度、任務要求及計算模型等信息,輸出文件:文件后綴名通常為,out或,log,除輸出作為計算結果的結構模型、軌道、密度矩陣、電荷布局等信息外,還包括了部分計算過程中輸出信息,對于大多數含有過渡金屬的結構、自由基結構、激發態,如二茂鐵、基態氧分子、羥基自由基等,均為開殼層體系,自旋多重度大于1,需做進一步判斷。