2切片厚度50～100nm為宜：太薄反差低；太厚反差好，但結構重疊，電子束不能穿透；，3切片應耐電子束的強烈照射，不變形不升華；，4切片能夠適當被染色，保證一定的反差；，5切片均勻，無影響拍照的皺褶、刀痕或染色污染，其中，DigitalMicrograph不僅能夠自動識別Gatan公司電鏡拍攝的dm3、dm4、Tif文件中的標尺、放大倍數、儀器型號等信息，還能夠對圖片中進行上偽色突出對比度、選區傅里葉變換、劃線取向灰度分析等。

鋨酸是強氧化劑，固定脂類、膜結構，有電子染色作用，3脫水，用適當的有機溶劑取代組織和細胞中的游離態水分，使之能與包埋劑混合，脫水要徹底，更換液體動作要迅速，脫水時間不宜過長，且固定后的樣品要充分漂洗，4滲透、包埋與聚合，4，1滲透，2包埋與聚合，加溫在60℃聚合形成固體基質，牢固地支撐整個細胞結構或組織，制成適于機械切割的固體樹脂包埋塊，利于切片，常用玻璃刀、鉆石刀進行超薄切片，刀上要裝水槽，并注入槽液。

染色方法有單染，包括鉛鹽單染和鈾鹽單染；雙染色，醋酸鈾染色和檸檬酸鉛染色，雙染色呈現結果更全面，我們一般采用的雙染法進行染色，常用染色劑：醋酸鈾，有微弱的放射性，主要染核酸、核蛋白、細胞核、結締組織，檸檬酸鉛，主要染膜結構、脂類、糖原等，易與CO2反應成沉淀，染色中應采取措施避免，電鏡照片主要解析粒徑分布、單晶/多晶、晶面結構、元素和原子分散，其本質是信號的空間分布，基本機理與比例尺地圖是一致的。